Passat B6 byl svého času největším a nejluxusnějším Passatem, který kdy automobilka Volkswagen postavila. Uvnitř interiéru najdete celou řadu důmyslných a praktických detailů. Sedadla Passatu B6 jsou pohodlná a odkládací kapsy ve dveřích u řidiče a spolujezdce jsou tvarované tak, že se do nich vejde litrová láhev vody nebo vína, nebo čehokoliv jiného, co hodláte po cestě konzumovat. Vedle již zmíněných odkládacích ploch pro láhve je tu například držák na deštníky, který mimochodem vlastní i modely Škody Superb. Se Superbem sdílí Passat i funkční prvky zavazadelníku. Tak například už se vám nestane, že byste celý obsah tašek s nákupem našli rozházený po podlaze kufru. Tašky totiž můžete snadno zavěsit na připravené háčky. Na bocích jsou dvě příjemně velké kapsy, kam snadno schováte jednotlivé věci, které by jinak za jízdy mohly létat po celém zavazadlovém prostoru. Pod podlahou zavazadelníku se skrývá plnohodnotná rezerva a jízda s ní neomezuje vůz v rychlosti. Passat B6 disponuje elektrickou parkovací brzdou. Stačí stisknout tlačítko označené P a brzdové kotouče se elektricky sepnou. Parkovací brzdu dokonce můžete použít k nouzovému brzdění s účinností 60% a výhodou je i automatické uvolnění brzdy jakmile se dá vozidlo do pohybu. Díky tomu, že mezi předními sedadly chybí páka mechanické parkovací brzdy, zbyl tu dostatečný prostor na držáky plechovek a další odkládací kumbálek, který se může schovat pod zatahovací clonou. Zadní sedadla lze sklopit, takže je možné převážet i dlouhé předměty. Za středovou loketní opěrkou zadních sedadel se skrývá tunýlek, který se ideálně hodí na přepravu lyží. U zadních sedadel ještě zůstaneme. Na rozdíl od Audi A6 se na nich totiž opravdu pohodlně svezou tři pasažéři a středové sedadlo má dokonce i dobrou bederní opěrku. Passat B6 můžeme beze studu prohlásit za pětimístný. Vůz má několik airbagů. Ten u spolujezdce je jednoduše vypnutelný v případě, že je na předním sedadle převáženo malé dítě v protisměrné dětské sedačce a pěkná funkce je i upozornění automobilu, že airbag u spolujezdce je vypnutý v případě, že na sedadle sedí dospělý. Palubní systém je možné pomocí Bluetooth spojit s mobilním telefonem a za příplatek vlastní Passat B6 i sound-systém Dynaudio.
40%